上海市环境监测中心主要承担上海市行政管辖范围的环境质量监测和污染源监测工作，包括水、大气环境质量、土壤、固体废弃物、环境噪声以及一些敏感地区的环境监测工作，如饮用水源取水口等。为上海市的环境管理和决策提供技术监督、技术支持和技术服务，是全市环境监测系统的网络中心、技术中心、信息中心和培训中心。
通过与科研合作伙伴携手合作，上海环境监测中心的科学家团队，通过使用意大利CIENL提供的气体发生器， 配合WATERS液质联用仪来分析环境样品中的污染物并记录其化学成分信息。CIENL还全程现场使用培训及后续技术支持。